生物分子

生物分子

生物分子词汇表

单体 - 构成长链的单个亚基,称为聚合物

聚合物 - 由重复亚基(单体)组成的长链

单糖 - 碳水化合物的最小亚基(葡萄糖、半乳糖、果糖)

氨基酸 - 多肽的最小亚基;有20种不同的天然存在的氨基酸

核苷酸 - DNA和RNA的最小亚基

缩合反应 - 释放水分子的反应,在此过程中,从单体形成更大的分子(聚合物)

水解反应 - 使用水将更大的分子分解成其更小的替代部分,断裂化学键。

v • d • e

单体和聚合物[编辑 | 编辑源代码]

缩合反应将单体连接成更大的分子,释放水

单糖 → 二糖 → 多糖:形成糖苷键

氨基酸 → 多肽:肽键

甘油 + 脂肪酸 → 甘油三酯:酯键

碳水化合物[编辑 | 编辑源代码]

由单糖(碳水化合物的单体)组成

常见的单糖 - 葡萄糖、半乳糖、果糖

二糖由两个单糖的缩合反应形成

麦芽糖 → 葡萄糖 + 葡萄糖

蔗糖 → 葡萄糖 + 果糖

乳糖 → 葡萄糖 + 半乳糖

α-葡萄糖形式,最右侧碳上的 -OH 基团指向下方

葡萄糖[编辑 | 编辑源代码]

两种异构体

α-葡萄糖:碳原子 1 上氢原子指向上方,羟基指向下方

β-葡萄糖:碳原子 1 上氢原子和羟基翻转

β-葡萄糖,显示最右侧 -OH 基团指向上方

缩略词“ADDUD”和“BUDUD”可用于记忆 -OH 基团的指向方式。ADDUD - α-葡萄糖,下、下、上、下。BUDUD - β-葡萄糖,上、下、上、下。

多糖[编辑 | 编辑源代码]

由许多单糖缩合形成糖原 → α-葡萄糖缩合

淀粉 → α-葡萄糖缩合

纤维素 → β-葡萄糖缩合

糖原的结构动物体内的能量储存

高度分支的结构,卷曲 - 所以紧凑

无法从细胞中扩散出去,因此保留在需要的地方,直到需要能量

纤维素的结构无分支的线性链

用于植物细胞壁 - 为植物提供刚性淀粉、糖原和纤维素的结构。可以看出分子堆积在一起的方式,所有纤维素分子都平行且紧密堆积在一起。淀粉和糖原分子具有更分支的结构,导致堆积不那么紧密

纤维聚集在一起形成微纤维 - 氢键(大量的强度)

淀粉的结构形成颗粒 - 无法从形成它的细胞中移动出去 - 不必扩散很远,因此可以相当快地获得能量

分支链,卷曲 - 紧凑

脂类[编辑 | 编辑源代码]

甘油三酯甘油 + 3 个脂肪酸尾部

形成油、蜡、脂肪

疏水性 - 不与水混合

甘油三酯的分子结构

磷脂形成细胞壁 - 磷脂双层

磷酸盐 + 甘油 + 2 个脂肪酸尾部

极性分子 - 磷酸头部是亲水的(喜水)// 脂肪酸尾部是疏水的(厌水)

磷脂的分子结构

脂肪酸饱和 - 所有碳原子都具有单键 - 具有可能的最大氢原子数量

不饱和单不饱和 - 1 对碳原子具有双键;去除 2 个氢原子,导致链发生扭结

多不饱和 - 1 对以上的碳原子具有双键;去除 2 个以上的氢原子,导致链发生多个扭结

与不饱和脂肪酸相比,能量含量更低

多不饱和脂肪酸

蛋白质[编辑 | 编辑源代码]

由氨基酸组成

蛋白质(多肽)的单体 - 氨基酸的通用结构

胺基:NH2 羧基:COOH

R 基团 - 使氨基酸独特的侧链

二肽 - 两个氨基酸缩合

多肽 - 许多氨基酸缩合

蛋白质可以由多个多肽链组成

蛋白质关键词

氨基酸 - 蛋白质是由其组成的单体

二肽 - 2 个氨基酸通过 1 个肽键连接在一起

多肽 - 许多氨基酸通过肽键连接在一起

一级结构]] - 蛋白质的第一个结构。氨基酸链 + 顺序

二级结构 - 蛋白质的第二个结构。α-螺旋和β-折叠

三级结构 - 蛋白质的第三个结构。α-螺旋和β-折叠折叠成 3D 结构

四级结构 - 将三级结构蛋白质连接在一起形成更大的分子

酶 - 一种能够催化分子分解/形成的蛋白质分子

诱导契合模型 - 理论表明,当底物附着时,酶的活性位点会略微改变形状

锁钥模型 - 理论表明,酶的活性位点是刚性的,并且永远不会改变形状

v • d • e

一级结构:氨基酸的顺序 - 多肽链

二级结构:α-螺旋或β-折叠 - 由 R 基团之间的氢键形成

三级结构:α-螺旋/β-折叠的进一步卷曲 - 更紧凑

四级结构:将多个三级结构多肽链连接在一起

氢键 - 在四级结构中将多肽链连接在一起

离子键 - 将氨基酸连接成多肽链

二硫键 - R 基团之间牢固的键,将 α-螺旋/β-折叠连接在一起蛋白质可以存在的四个结构

酶[编辑 | 编辑源代码]

降低它催化的反应的活化能

酶作用的锁钥模型底物完美地契合酶

没有解释酶如何催化反应

酶作用的诱导契合模型酶活性位点略微改变形状,以允许底物与之结合

活性位点对底物施加压力,导致键断裂

反应被催化,导致产物被释放

酶只能让 1 个底物与之契合 - 淀粉酶只能催化淀粉水解

酶浓度 - 较高的浓度会导致底物更快地分解。随着底物浓度的降低,反应速率将达到平台期,因为碰撞发生的可能性降低了

底物浓度 - 较高的底物浓度意味着酶与底物发生碰撞的可能性更高。反应速率增加,直到一定程度。一旦所有酶的活性位点都有底物,反应就无法继续进行竞争性和非竞争性抑制剂

抑制剂浓度 - 较高浓度的竞争性抑制剂会导致反应减慢,因为更多的竞争性抑制剂会阻断活性位点。非竞争性抑制剂也会产生影响,但是它不取决于浓度,因为它们不会阻断活性位点

pH - 超出酶的最佳 pH 值,活性位点会迅速变性。这会阻止反应被催化

温度 - 低于最佳温度,反应会减慢,因为引起碰撞的能量更少。高于最佳温度 - 反应停止 - 酶变性酶在不同温度下的活性酶在不同 pH 值下的活性

核酸[编辑 | 编辑源代码]

核酸词汇表

DNA – 脱氧核糖核酸;构成所有活细胞遗传物质的分子。双链结构

RNA – 核糖核酸;用于将遗传物质转移到核糖体的分子;包含(一些)病毒的整个基因组,但并非全部。单链结构

核苷酸 – 构成 DNA 和 RNA 的单个单体

碱基 – 胞嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、腺嘌呤;互补于碱基,仅允许 (A,T/U)、(G,C) 结合在一起(通过氢键)

半保留复制 – 该理论指出,在 DNA 复制过程中,一条链是新的,一条链是旧的。确保细胞之间遗传的连续性,降低突变的可能性

v • d • e

DNA 的双螺旋结构

生物体的遗传物质

腺嘌呤(嘌呤)、胸腺嘧啶/尿嘧啶(嘧啶)、鸟嘌呤(嘌呤)、胞嘧啶(嘧啶)半保留复制:紫色链是原始链,橙色链是新链

半保留复制DNA 解旋:DNA 解旋酶

碱基对在解旋的链之间移动

DNA 聚合酶用于将新的碱基结合到旧链上

形成 2 条 DNA 链,每条链都有 1 条旧链和 1 条新链

半保留复制的证明DNA 复制,直到所有氮元素都是 15N - 这更重,导致链在溶液中处于较低位置

然后 DNA 在 14N 中复制一代 - 这会创建一个杂合 DNA,其中 50% 为 15N,50% 为 14N

DNA 在 14N 溶液中再复制一代 - 创建包含 25% 15N 和 75% 14N 的 DNA

重复此过程,最终形成仅包含 14N 的 DNA

溶液可以进行离心,识别包含不同氮元素同位素的 DNA

ATP – 三磷酸腺苷[编辑 | 编辑源代码]

ATP,碱基(腺苷)用红色圈出

用于在细胞内转移能量

由以下部分构成:腺嘌呤、3 个磷酸基团、核糖

A T P + H 2 O → A D P + P i {\displaystyle ATP+H_{2}O\rightarrow ADP+P_{i}} – ATP 上的缩合反应,形成 ADP 和一个磷酸基团;断裂键释放能量

低活化能,因此很容易释放能量

ATP 酶 - 催化 ATP 水解(ATP 分解为 ADP)的酶

光合磷酸化

光合作用:仅植物进行,利用光合成 ADP → ATP

氧化磷酸化利用呼吸合成 ADP → ATP;植物和动物

底物水平磷酸化当磷酸基团从供体转移时;植物和动物

ATP 的用途

代谢过程 - 提供能量,从亚基构建分子

运动 - 肌肉收缩需要能量主动运输 - 分子逆浓度梯度移动

分泌 - ATP 需要形成溶酶体以包裹细胞产物

分子活化 - ATP 水解中释放的无机磷酸可以磷酸化其他分子

水[编辑 | 编辑源代码]

水分子图,显示更负和更正的端通过氢键相互作用

对所有生物体至关重要

极性分子水分子之间的氢键需要大量能量才能断裂

导致水具有高表面张力

溶剂由于水是极性的,其他极性分子能够溶解在其中

离子化合物溶解时会被水分子包围

允许气体溶解 - CO2、O2、NH3...

高比热容提高 1° 温度需要大量能量 - 这是由于氢键的强度

这意味着水起缓冲作用,减少温度波动

高汽化潜热将水蒸发(成蒸汽)需要大量能量

非常适合冷却生物体 - 出汗(动物)或蒸腾作用(植物)

分子之间的内聚力高表面张力意味着可以将水柱拉到容器(如木质部)中

代谢物用于缩合/水解反应,断裂/形成键

无机离子[编辑 | 编辑源代码]

存在于细胞质/体液中的溶液中

一些离子浓度高,另一些离子浓度低

每个离子都有特定的作用铁离子 血红蛋白

钠离子 葡萄糖和氨基酸的协同运输

磷酸根离子 DNA 和 ATP 的组成部分

物质检测[编辑 | 编辑源代码]

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