生物分子词汇表
单体 - 构成长链的单个亚基,称为聚合物
聚合物 - 由重复亚基(单体)组成的长链
单糖 - 碳水化合物的最小亚基(葡萄糖、半乳糖、果糖)
氨基酸 - 多肽的最小亚基;有20种不同的天然存在的氨基酸
核苷酸 - DNA和RNA的最小亚基
缩合反应 - 释放水分子的反应,在此过程中,从单体形成更大的分子(聚合物)
水解反应 - 使用水将更大的分子分解成其更小的替代部分,断裂化学键。
v • d • e
单体和聚合物[编辑 | 编辑源代码]
缩合反应将单体连接成更大的分子,释放水
单糖 → 二糖 → 多糖:形成糖苷键
氨基酸 → 多肽:肽键
甘油 + 脂肪酸 → 甘油三酯:酯键
碳水化合物[编辑 | 编辑源代码]
由单糖(碳水化合物的单体)组成
常见的单糖 - 葡萄糖、半乳糖、果糖
二糖由两个单糖的缩合反应形成
麦芽糖 → 葡萄糖 + 葡萄糖
蔗糖 → 葡萄糖 + 果糖
乳糖 → 葡萄糖 + 半乳糖
α-葡萄糖形式,最右侧碳上的 -OH 基团指向下方
葡萄糖[编辑 | 编辑源代码]
两种异构体
α-葡萄糖:碳原子 1 上氢原子指向上方,羟基指向下方
β-葡萄糖:碳原子 1 上氢原子和羟基翻转
β-葡萄糖,显示最右侧 -OH 基团指向上方
缩略词“ADDUD”和“BUDUD”可用于记忆 -OH 基团的指向方式。ADDUD - α-葡萄糖,下、下、上、下。BUDUD - β-葡萄糖,上、下、上、下。
多糖[编辑 | 编辑源代码]
由许多单糖缩合形成糖原 → α-葡萄糖缩合
淀粉 → α-葡萄糖缩合
纤维素 → β-葡萄糖缩合
糖原的结构动物体内的能量储存
高度分支的结构,卷曲 - 所以紧凑
无法从细胞中扩散出去,因此保留在需要的地方,直到需要能量
纤维素的结构无分支的线性链
用于植物细胞壁 - 为植物提供刚性淀粉、糖原和纤维素的结构。可以看出分子堆积在一起的方式,所有纤维素分子都平行且紧密堆积在一起。淀粉和糖原分子具有更分支的结构,导致堆积不那么紧密
纤维聚集在一起形成微纤维 - 氢键(大量的强度)
淀粉的结构形成颗粒 - 无法从形成它的细胞中移动出去 - 不必扩散很远,因此可以相当快地获得能量
分支链,卷曲 - 紧凑
脂类[编辑 | 编辑源代码]
甘油三酯甘油 + 3 个脂肪酸尾部
形成油、蜡、脂肪
疏水性 - 不与水混合
甘油三酯的分子结构
磷脂形成细胞壁 - 磷脂双层
磷酸盐 + 甘油 + 2 个脂肪酸尾部
极性分子 - 磷酸头部是亲水的(喜水)// 脂肪酸尾部是疏水的(厌水)
磷脂的分子结构
脂肪酸饱和 - 所有碳原子都具有单键 - 具有可能的最大氢原子数量
不饱和单不饱和 - 1 对碳原子具有双键;去除 2 个氢原子,导致链发生扭结
多不饱和 - 1 对以上的碳原子具有双键;去除 2 个以上的氢原子,导致链发生多个扭结
与不饱和脂肪酸相比,能量含量更低
多不饱和脂肪酸
蛋白质[编辑 | 编辑源代码]
由氨基酸组成
蛋白质(多肽)的单体 - 氨基酸的通用结构
胺基:NH2 羧基:COOH
R 基团 - 使氨基酸独特的侧链
二肽 - 两个氨基酸缩合
多肽 - 许多氨基酸缩合
蛋白质可以由多个多肽链组成
蛋白质关键词
氨基酸 - 蛋白质是由其组成的单体
二肽 - 2 个氨基酸通过 1 个肽键连接在一起
多肽 - 许多氨基酸通过肽键连接在一起
一级结构]] - 蛋白质的第一个结构。氨基酸链 + 顺序
二级结构 - 蛋白质的第二个结构。α-螺旋和β-折叠
三级结构 - 蛋白质的第三个结构。α-螺旋和β-折叠折叠成 3D 结构
四级结构 - 将三级结构蛋白质连接在一起形成更大的分子
酶 - 一种能够催化分子分解/形成的蛋白质分子
诱导契合模型 - 理论表明,当底物附着时,酶的活性位点会略微改变形状
锁钥模型 - 理论表明,酶的活性位点是刚性的,并且永远不会改变形状
v • d • e
一级结构:氨基酸的顺序 - 多肽链
二级结构:α-螺旋或β-折叠 - 由 R 基团之间的氢键形成
三级结构:α-螺旋/β-折叠的进一步卷曲 - 更紧凑
四级结构:将多个三级结构多肽链连接在一起
氢键 - 在四级结构中将多肽链连接在一起
离子键 - 将氨基酸连接成多肽链
二硫键 - R 基团之间牢固的键,将 α-螺旋/β-折叠连接在一起蛋白质可以存在的四个结构
酶[编辑 | 编辑源代码]
降低它催化的反应的活化能
酶作用的锁钥模型底物完美地契合酶
没有解释酶如何催化反应
酶作用的诱导契合模型酶活性位点略微改变形状,以允许底物与之结合
活性位点对底物施加压力,导致键断裂
反应被催化,导致产物被释放
酶只能让 1 个底物与之契合 - 淀粉酶只能催化淀粉水解
酶浓度 - 较高的浓度会导致底物更快地分解。随着底物浓度的降低,反应速率将达到平台期,因为碰撞发生的可能性降低了
底物浓度 - 较高的底物浓度意味着酶与底物发生碰撞的可能性更高。反应速率增加,直到一定程度。一旦所有酶的活性位点都有底物,反应就无法继续进行竞争性和非竞争性抑制剂
抑制剂浓度 - 较高浓度的竞争性抑制剂会导致反应减慢,因为更多的竞争性抑制剂会阻断活性位点。非竞争性抑制剂也会产生影响,但是它不取决于浓度,因为它们不会阻断活性位点
pH - 超出酶的最佳 pH 值,活性位点会迅速变性。这会阻止反应被催化
温度 - 低于最佳温度,反应会减慢,因为引起碰撞的能量更少。高于最佳温度 - 反应停止 - 酶变性酶在不同温度下的活性酶在不同 pH 值下的活性
核酸[编辑 | 编辑源代码]
核酸词汇表
DNA – 脱氧核糖核酸;构成所有活细胞遗传物质的分子。双链结构
RNA – 核糖核酸;用于将遗传物质转移到核糖体的分子;包含(一些)病毒的整个基因组,但并非全部。单链结构
核苷酸 – 构成 DNA 和 RNA 的单个单体
碱基 – 胞嘧啶、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、腺嘌呤;互补于碱基,仅允许 (A,T/U)、(G,C) 结合在一起(通过氢键)
半保留复制 – 该理论指出,在 DNA 复制过程中,一条链是新的,一条链是旧的。确保细胞之间遗传的连续性,降低突变的可能性
v • d • e
DNA 的双螺旋结构
生物体的遗传物质
腺嘌呤(嘌呤)、胸腺嘧啶/尿嘧啶(嘧啶)、鸟嘌呤(嘌呤)、胞嘧啶(嘧啶)半保留复制:紫色链是原始链,橙色链是新链
半保留复制DNA 解旋:DNA 解旋酶
碱基对在解旋的链之间移动
DNA 聚合酶用于将新的碱基结合到旧链上
形成 2 条 DNA 链,每条链都有 1 条旧链和 1 条新链
半保留复制的证明DNA 复制,直到所有氮元素都是 15N - 这更重,导致链在溶液中处于较低位置
然后 DNA 在 14N 中复制一代 - 这会创建一个杂合 DNA,其中 50% 为 15N,50% 为 14N
DNA 在 14N 溶液中再复制一代 - 创建包含 25% 15N 和 75% 14N 的 DNA
重复此过程,最终形成仅包含 14N 的 DNA
溶液可以进行离心,识别包含不同氮元素同位素的 DNA
ATP – 三磷酸腺苷[编辑 | 编辑源代码]
ATP,碱基(腺苷)用红色圈出
用于在细胞内转移能量
由以下部分构成:腺嘌呤、3 个磷酸基团、核糖
A T P + H 2 O → A D P + P i {\displaystyle ATP+H_{2}O\rightarrow ADP+P_{i}} – ATP 上的缩合反应,形成 ADP 和一个磷酸基团;断裂键释放能量
低活化能,因此很容易释放能量
ATP 酶 - 催化 ATP 水解(ATP 分解为 ADP)的酶
光合磷酸化
光合作用:仅植物进行,利用光合成 ADP → ATP
氧化磷酸化利用呼吸合成 ADP → ATP;植物和动物
底物水平磷酸化当磷酸基团从供体转移时;植物和动物
ATP 的用途
代谢过程 - 提供能量,从亚基构建分子
运动 - 肌肉收缩需要能量主动运输 - 分子逆浓度梯度移动
分泌 - ATP 需要形成溶酶体以包裹细胞产物
分子活化 - ATP 水解中释放的无机磷酸可以磷酸化其他分子
水[编辑 | 编辑源代码]
水分子图,显示更负和更正的端通过氢键相互作用
对所有生物体至关重要
极性分子水分子之间的氢键需要大量能量才能断裂
导致水具有高表面张力
溶剂由于水是极性的,其他极性分子能够溶解在其中
离子化合物溶解时会被水分子包围
允许气体溶解 - CO2、O2、NH3...
高比热容提高 1° 温度需要大量能量 - 这是由于氢键的强度
这意味着水起缓冲作用,减少温度波动
高汽化潜热将水蒸发(成蒸汽)需要大量能量
非常适合冷却生物体 - 出汗(动物)或蒸腾作用(植物)
分子之间的内聚力高表面张力意味着可以将水柱拉到容器(如木质部)中
代谢物用于缩合/水解反应,断裂/形成键
无机离子[编辑 | 编辑源代码]
存在于细胞质/体液中的溶液中
一些离子浓度高,另一些离子浓度低
每个离子都有特定的作用铁离子 血红蛋白
钠离子 葡萄糖和氨基酸的协同运输
磷酸根离子 DNA 和 ATP 的组成部分
物质检测[编辑 | 编辑源代码]